MANUDB: database and application to retrieve and visualize mammalian NUMTs
Database, Volume 2025, 2025, baaf009,
https://doi.org/10.1093/database/baaf009
A mitokondriális szekvenciák folyamatos genetikai áramlással épülnek be a sejtmagi genomba, és fontos szerepet töltenek be az evolúciós folyamatok és a rákos transzformációk hátterében. Ezek a beépült szekvenciák (ún. NUMT-ok) jelentőséggel bírnak a genomösszeállításban, valamint a filogenetikai és forenzikai vizsgálatokban is. Kutatócsoportunk korábban létrehozott egy számítógépes eljárást ezen szekvenciák egységes azonosítására az emlős genomokban, melynek eredményeit most a nyilvánosság számára is elérhetővé teszik. Ezt a célt szolgálja a MANUDB (MAmmalian NUclear mitochondrial sequences DataBase) adatbázis (elérhető a manudb.streamlit.app címen), amely lehetővé teszi a felhasználók számára, hogy lekérdezzék és vizualizálják az emlős fajok sejtmagi genomjába integrálódott mitokondriális genomi fragmentumokat.
B. BIRÓ,
Z. GÁL,
ZS. NAGY,
J. F. GARCIA,
TSEND-AYUSH BATBOLD,
O. I. HOFFMANN
Emlősök